
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱怪物 为其提供 TMT血清组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
研究探讨最后
研究方案成员实验设计逐渐冷冻箱精力延迟了鸡肉片的氏硬度标准、持来说水力、色彩、矿酸铁含锌量、ROS、脂质过硫化物、MDA、GSH和GPX4质量来评价指标全身肌肉组织性生殖神经细胞的铁牺牲方式。效果体现,冷冻箱精力延迟了后,鸡肉片的氏硬度标准在第3天和第6天重要下滑;持水的能力降低;颜色搭配变深,得不到光泽度,鲜橙灰色就来为暗橙灰色。不仅,矿酸铁、灵活性氧和MDA的含锌量重要提高,生殖神经细胞凋亡率重要提高。 探讨员工转化成有之间的关系 冷库时间段的手臂腹肌产品的样本的血清质,第三做出SDS-PAGE探讨,血清质条带在有之间的关系 末期分布图平滑且形似(图1a)。要根据血清在有之间的关系 产品的样本中的表达出具体情况,探讨得知一致组产品的样本的中五位数比较敏感于一致技术(图1b),阐明手臂腹肌产品的样本血清质拥有不错的组内形似性和组间之间的关系性。 蛋清质组学共鉴别结论出1996种蛋清质。以B0为比对组,挑选B1、B2、B4和B6中的蛋清开始异同展示进行定量分析,共鉴别结论到376个DEPs。将火山图可视化管理,并按照FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两种基准进行定量分析DEP。结局如图随时1c-f随时,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分头别鉴别结论出22、33、73和140个DEPs,但其中分头别调整6、11、32和815个,调整16、22、41和5二个。聚类分析具体方法监测了的不同冷冻价段肌群集体中蛋清质的展示,结局出现肌群蛋清展示异同伴随存贮日期的曾加而曾加(图1g)。
图1| 不同的速冻精力的肌肤仿品蛋清质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 的不同冷库时段的身体肌肉备样地域差异血清浅析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁身亡淀粉酶肽的PRM酶联免疫法定性分析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 立于KEGG丰度差异性传达淀粉酶的铁伤亡规则(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生态学提供了TMT降钙素原检测蛋清质组学新保障咨询培训,拜谱生物工艺已研发部搞定并成立了完整稳定的转录组学、蛋清组学、分解代谢组学和两组学联和车辆新保障咨询培训指标体系,欢迎致电咨询!
参看论文资料:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.