草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿装置最经通常的消化道疾病组成。肾结构中CaOx氯化钠晶体过饱满积聚会使得肾小管组织细胞问题和凋亡，因而使得肾结石的进行。短链皮下脂肪堆积酸由胃肠内厌氧反应器杆菌进行发酵饮食营养植物纤维产生了，不止在部分区域胃肠障壁中激发效应，同时还在装置含量上也激发要素效应。表中，丁酸是最丰富性的短链皮下脂肪堆积酸，拥有消除炎症和天然免疫压制效应,本论述浅议丁酸对CaOx肾结石的效应简答隐藏的靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山诊所泌尿产科吴忠博土生导师、周子健博土于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠教学、周子健博后在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生物学与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了网络信息药理学学贴心服务，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

好的文章明称：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 玩家工作单位：华山的医院 探析客体：大鼠、HK-2血细胞 好友分组信息查询：剖析组（Con）、模特组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱带来了技巧：wifi网络药剂学学加测

总体目标操作步骤

探索最终结果

研发者前提建设方案大鼠模式，能够生物学生化学因素和机构方面的问题学染料等研发方法察觉到丁酸也可以缩短CaOx模式大鼠肾CaOx单晶体的型成和伤到，调节CaOx模式大鼠的炎症病变伤到和腐蚀产品的过量表达爱。再者，丁酸还抑制作用作用草酸帮助的HK-2体肿瘤细胞伤到、腐蚀应激反应和体肿瘤细胞凋亡。 为探讨丁酸成分和靶什么是表观遗传微信网格，科研工人从PubChem收集丁酸和丁酸酯的二维和三维图成分（图1A）。依据PharmMapper统计资料统计库和Uniprot统计资料统计库操作后共挑选出116个丁酸靶什么是表观遗传供进一大步深入数据探讨。将什么是表观遗传列表框引入STRING统计资料统计库，实现PPI微信网格深入数据探讨。Cytoscape给予了排列的前20的核心区靶什么是表观遗传的详细介绍微信网格图，例如CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。哪些核心区什么是表观遗传与微信网格中的其它什么是表观遗传均表面出必须的涉及到性，说明书怎么写哪些什么是表观遗传几率充分利用着联动的功效。GO和KEGG深入数据探讨体现了了丁酸核心区什么是表观遗传的涉及到途经和动物学系统（图1C）。核心区什么是表观遗传重点与类固醇抗生素回话、氧化物现象应激症状现象回话、特异性氧氧组织细胞对类固醇抗生素条件刺激的现象同时对偏酸检查是否杂质的现象关与。上述情况经验，哪些核心区什么是表观遗传重点陆续参与了氧化物现象应激症状现象和对特异性氧氧的动物现象步骤，是肾结石造成考核机制中至关关键性的途经，这体现了丁酸几率在肾结石中充分利用关键性的功效。

图1| 丁酸型式与靶什么是基因数据网络讲解(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进第一步探秘丁酸对CaOx肾结石实际上切靶dna，探讨人数采取GEO数值库对GSE73680中安全健康对比与CaOx肾结石女性的dna不同决定了探讨。对比组与CaOx结石女性的不错性性不同表现dna（DEGs）检测标准为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共选择到3783个dna的发生不错性发展，进来3379个（89.4%）dna表现调整，404个（10.6%）dna表现调低（图2A）。对DEGs决定聚类算法探讨探讨，热图彰显了前10个被选中DEGs的二维分出层次聚类算法探讨基本特征（图2B）。然后，探讨人数实现GeneCards数值库人工正确处理监定了370个可以与CaOx肾结石有关于的的dna，排行榜前20位的推测dna以及其有关于的性评价长为2C一样。方便看到丁酸根治CaOx肾结石的关键所在靶点，探讨人数将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石有关于的dna正确处理得出新一个Venn图。终究，CYP2C9被决定为丁酸干扰CaOx肾结石的意向靶点(图2D)。凡此种种，探讨人数还决定了丁酸与CYP2C9的碳原子接入，CYP2C9的四个核苷酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸互为的功效，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在使用系统临床药理学预估CYP2C9是丁酸影晌CaOx肾结石的靶染色体后，分析人数还依据癌组织细胞检测得知了CYP2C9可缩减草酸分析的HK-2癌组织细胞的ROS能力、炎症病变伤害和凋亡。

图2| 许多据库联动进行分析預测CYP2C9是丁酸功能于CaOx肾结石的靶DNA

探究然而

本研究探讨率先会出现丁酸在身体外和胃中均能减缓CaOx肾结石建模的阳极被氧化应激性状态和发炎板材损害，随即在网站数据临床临床药理学需求拥有丁酸影响到CaOx肾结石的隐藏靶点——CYP2C9，最终在组织试验说明CYP2C9在草酸盐分析的HK-2组织ROS能力、发炎板材损害和凋亡。以下会出现说明丁酸概率在减缓CYP2C9来减缓CaOx肾结石的阳极被氧化应激性状态，消减发炎板材损害。这种步骤中拜谱微微生物带来了了网站数据临床临床药理学技術功能，与此同时拜谱微微生物可不断提高旺盛期改善的dna组学、核营养素组学、新陈代谢组学等两组学设备及技術功能，感谢转达咨询了解。！ 参看论文：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.